新冠病毒突變株B.1.1.7簡(jiǎn)介
B.1.1.7突變毒株,又稱20I/501Y.V1或VOC 202012/01,2020年12月在英國(guó)最早被發(fā)現(xiàn),隨后在美國(guó)、加拿大、日本等多個(gè)國(guó)家都報(bào)道了B.1.1.7譜系的病例。B.1.1.7突變毒株與人ACE2受體結(jié)合親和力提高了1000倍, 傳染能力是原始毒株的1.7倍。B.1.1.7譜系在D614G突變的基礎(chǔ)上一次性獲得了17個(gè)突變位點(diǎn),S蛋白上包含9個(gè)突變位點(diǎn):
1)位于S1 N末端結(jié)構(gòu)域(NTD)的69-70, Y144位氨基酸缺失;
2)位于受體結(jié)合域(RBD)上的N501Y突變;
3)位于S1 C末端結(jié)構(gòu)域的A570D, D614G, P681H;
4)位于S2上的T716I, S982A, D1118H。
關(guān)鍵突變位點(diǎn)對(duì)SARS-CoV-2功能的影響
1.69-70del
該突變表現(xiàn)為新冠N端結(jié)構(gòu)域(NTD)中H69和V70缺失,單一的H69/V70缺失并不常見,其常常伴隨著RBD突變。除了B.1.1.7病毒株(N501Y+69-70del)外、丹麥水貂突變毒株(N439K+Y453F+69-70del)也呈現(xiàn)這種趨勢(shì)。H69/V70缺失會(huì)使周圍I68、S71、G72、T73、N74和G75向內(nèi)移動(dòng)形成突起環(huán),并靠近NTD的結(jié)合表位。已有研究表明NTD中的H69/V70缺失可以逃避NTD特異結(jié)合中和抗體的途徑,有利于病毒逃離宿主的免疫反應(yīng),但目前尚未明確免疫逃逸是由H69/V70缺失導(dǎo)致的NTD構(gòu)象引起的。
2.D614G突變
D614G突變具有更強(qiáng)的感染性,目前是新冠突變毒株的主要形式。D614G突變會(huì)增加S1/S2交界處Furin蛋白酶切割效率。當(dāng)D突變?yōu)镚時(shí),D614殘基與相鄰原聚體S2區(qū)域上T859殘基形成的氫鍵消失,提升了Furin蛋白酶切割效率,使得S1蛋白更易從S2蛋白-病毒膜融合體上脫落,促進(jìn)病毒膜融合進(jìn)程,暗示D614G突變對(duì)宿主細(xì)胞具有更強(qiáng)或更快的感染力。同時(shí),D614G還會(huì)改變RBD蛋白的構(gòu)象去更好地與ACE2配位。D614毒株中,53%RBD聚體為全封閉,47%為單開放,40%的RBD處于“向上”狀態(tài);G614毒株中,5%為全封閉,36%為單開放,39%為雙開放,20%為三開放,82%的RBD處于“向上”狀態(tài)。這種更高的RBD狀態(tài)“向上”的傾向以及更加開放的RBD聚體結(jié)構(gòu)使得D614G突變更易與ACE2結(jié)合。
3.N501Y
N501位氨基酸是新冠病毒RBD蛋白的關(guān)鍵接觸殘基之一,直接參與RBD和ACE2的結(jié)合作用,而N501Y突變?cè)鰪?qiáng)了RBD和ACE2的結(jié)合親和力。N501屬于親水性殘基,病毒結(jié)合ACE2時(shí),N501靠近ACE2的Y41疏水苯環(huán)和K353疏水烷烴鏈;但當(dāng)N501突變?yōu)槭杷畾埢鵜時(shí),Y501則可以通過疏水作用與ACE2中的Y41和K353更好的配位,改善RBD和ACE2互作構(gòu)象,將結(jié)合親和力提高約0.81kcal/mol,同時(shí)使原來不感染小鼠的新冠病毒毒株獲得感染能力。N501Y突變對(duì)于靶向RBD中和表位的中和抗體的結(jié)合效力影響較小。研究發(fā)現(xiàn),N501毒株與中和抗體結(jié)合VH-Fc ab8后(該分子融合表達(dá)了可變重鏈區(qū)域VH和人類IgG1的Fc片段),S蛋白呈現(xiàn)兩種構(gòu)象即兩個(gè)RBD分子處于“向上”位置和僅有一個(gè)RBD分子處于“向上”位置。N501Y突變毒株的S蛋白則表現(xiàn)為單一構(gòu)象:兩個(gè)RBD分子處于“向上”位置。每個(gè)RBD分子都會(huì)綁定到VH-Fc ab8上,突變的存在不會(huì)改變RBD與中和抗體的相互作用,不存在免疫逃逸現(xiàn)象。
B.1.1.7突變毒株表現(xiàn)為與ACE2親和力增強(qiáng)、病毒傳染能力增強(qiáng),但是研究發(fā)現(xiàn)mRNA新冠疫苗BNT162b2接種者血清對(duì)于B.1.1.7毒株S蛋白中和活性影響不大,推測(cè)B.1.1.7突變毒株不會(huì)影響現(xiàn)有的疫苗及中和抗體研究。而南非突變株對(duì)中和效應(yīng)可能會(huì)帶來削弱影響。
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